为适应环境工程市场业务的发展、进一步优化工程设计技术力量配置和增强市场竞争力，同时根那建设部对设计资质证书承担实体的要求，2006年4月，环境保护部华南环境科学研究所以工会为依托，全资成立了广州华科环保工程有限公司，承接和继承了华南环境科学研究所原环境工程研究设计中心的全部环境工程设计资质证书，专门从事环境工程相关市场业务：
广州华科环保工程有限公同是一家集工程设计、体工总承包、环境咨询、污染治理授施运营等业务于一体的全方位服务专业环保公司，既具有锥厚技术力量，又具备丰富的工程经验。公司现有员工0余人，工程技术及研发人员50人，其中正高级职称/研究员3入，高级工程师11人，博士4人，硕士15人，所学专业涉及给排水、环境工程、环境科学、化工、建筑、结构、电气、自动控制、暖通空调、概预算、机械尊，业务范围包括污染控例技术研发，环保工程设计、施工安装及总承包，环保技术咨询，环保设施的运营管理，以及环保设备材料的生产与销售等。
公司现持有环境工程（水污染防治工程、大气污染防治工程）专项甲级、环境工程（固体度物处理处置工程、物理污染防治工程）专项乙级、环保工程专业承包贰级资质、广东省污染修复甲级证书、污染治理设施运行服务（工业废水处理二级)责质。自成立至今，公司技术团队共研究开发50多项污染治理技术，承担工程设计、总承包项目600余项，环保咨询300多项，环境污染治理设施运营项目20余项，业务遍布广东、广西、福建、海南、云南、安微、河南、山东、浙江、江苏、天津、港澳等地区。
公司与国内多所高等院校和科研机构、知名环保企业建立了广泛密切的联系，并与德国、加拿大、美国、荷兰、日本、法国等环保技术及产业化发达的国家有广泛的交流和合作，已成为环境污染控制领域一个集产、学、研为一体的高新技术实体。公司技术研发团队共参与国家、省、市级科研项目四十多项，现拥有环境污染治理专利技术二十多项，获省、部级科技进步奖6项，多项技术成果被转化应用，并被列入国家环保最佳实用技术。
